The Lattice Boltzmann Method (LBM) is a computational fluid dynamics (CFD) technique used to simulate fluid flow at a mesoscopic level. It is based on the kinetic theory of gases and solves the Boltzmann equation, which describes the behavior of particles in a fluid. In LBM, the fluid domain is divi……Read More
分类: 分子模拟
水模型—分子动力学
分别在 lj/cut/coul/cut 10.0 与 lj/cut/coul/long 条件下,对SPC/E水分子盒子在npt条件下进行模拟:
小分子的渲染效果展示
1.分子位置的导入
2.渲染效果图示
VMD重绘Nature图像
文章题目:Biophysics. The little big bang. DOI:10.1038/371740a0 原图 重绘后图片 参考文献: VMD 1.9.3 用户手册.pp:22
lammps中的atom_style(原子类型)的选择
atom_style定义了模拟过程中应选择什么系列的原子。 原子类型 考虑的效应 简述 angle bonds and angles bead-spring polymers with stiffness atomic only the default values 粗颗粒液体,固体,金属 body mass, inertia moments, quaternion, angular momentum arbitrary bodies bond bonds bead-spring polymers charge charge atomic system with charges dielect……Read More